maxUptakes.Rd
Function that compuate the maximum uptakes for all sequences in the dataset
maxUptakes(res)
An object of class DataFrame containing the results of the hdx-ms experiment
Returns a numeric vector of maximum uptakes
data("BRD4_apo")
BRD4_apo <- DataFrame(BRD4_apo)
maxUptakes(res = BRD4_apo)
#> [1] 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 18 18 18 18 18 18
#> [25] 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12
#> [49] 12 12 12 12 12 12 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10
#> [73] 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 15 15 15 15 15
#> [97] 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17
#> [121] 17 17 17 17 17 17 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
#> [145] 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 8 8 8 8 8 8
#> [169] 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16
#> [193] 16 16 16 16 16 16 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19
#> [217] 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 7 7 7 7 7 7
#> [241] 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10
#> [265] 10 10 10 10 10 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
#> [289] 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 4 4 4 4 4 4
#> [313] 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11
#> [337] 11 11 11 11 11 11 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14
#> [361] 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 5 5 5 5 5 5
#> [385] 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
#> [409] 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11
#> [433] 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22
#> [457] 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7
#> [481] 7 7 7 7 7 7 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11
#> [505] 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 4 4 4 4 4 4
#> [529] 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7
#> [553] 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7
#> [577] 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10
#> [601] 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12
#> [625] 12 12 12 12 12 12 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13
#> [649] 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 20 20 20 20 20 20
#> [673] 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21
#> [697] 21 21 21 21 21 21 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
#> [721] 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9
#> [745] 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10
#> [769] 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
#> [793] 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 5 5 5 5 5 5
#> [817] 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
#> [841] 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
#> [865] 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6 6
#> [889] 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10
#> [913] 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
#> [937] 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
#> [961] 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
#> [985] 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
#> [1009] 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 5 5 5 5 5 5
#> [1033] 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13
#> [1057] 13 13 13 13 13 13 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12
#> [1081] 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
#> [1105] 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
#> [1129] 6 6 6 6 6 6 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
#> [1153] 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 9 9 9 9 9 9
#> [1177] 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4
#> [1201] 4 4 4 4 4 4 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
#> [1225] 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 7 7 7
#> [1249] 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
#> [1273] 9 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
#> [1297] 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 8 8 8 8 8 8
#> [1321] 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16
#> [1345] 16 16 16 16 16 16 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7
#> [1369] 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 7 7 7 7
#> [1393] 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11
#> [1417] 11 11 11 11 11 11 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13
#> [1441] 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 17 17 17 17 17 17
#> [1465] 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
#> [1489] 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
#> [1513] 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 16 16 16 16 16 16
#> [1537] 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17
#> [1561] 17 17 17 17 17 17 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16
#> [1585] 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 13 13 13 13 13 13
#> [1609] 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 13 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
#> [1633] 6 6 6 6 6 6 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12
#> [1657] 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 19 19 19 19 19 19
#> [1681] 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
#> [1705] 9 9 9 9 9 9 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21
#> [1729] 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 8 8 8 8 8 8
#> [1753] 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12
#> [1777] 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12
#> [1801] 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 11 11 11 11 11 11
#> [1825] 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14
#> [1849] 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14 14
#> [1873] 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19
#> [1897] 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 19 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
#> [1921] 5 5 5 5 5 5 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10
#> [1945] 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 10 10 10 10
#> [1969] 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
#> [1993] 9 9 9 9 9 9 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
#> [2017] 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4